10月13日，福建前線電臺(tái)廣播了毛澤東起草的《中華人民共和國(guó)國(guó)防部長(zhǎng)命令》，宣布“從本日起，再停兩星期，借以觀察敵方動(dòng)態(tài)，并使金門軍民同胞得到充分補(bǔ)給”，同時(shí)指出“這是民族大義”，“是為了對(duì)付美國(guó)人的”。10月25日，毛澤東以國(guó)防部長(zhǎng)彭德懷名義發(fā)表了《再告臺(tái)灣同胞書》，揭露美國(guó)插手臺(tái)灣的目的，提醒臺(tái)灣當(dāng)局當(dāng)心美國(guó)人的毒計(jì)；規(guī)勸臺(tái)灣當(dāng)局，不可屈服美國(guó)人的壓力。毛澤東同時(shí)宣布“逢雙日不打金門的飛機(jī)場(chǎng)、料羅灣的碼頭、海灘和船只……以利你們長(zhǎng)期固守”。這樣，對(duì)金門“打單不打雙”的局面，一直延續(xù)到1979年1月1日。

　　毛澤東親自撰寫以國(guó)防部長(zhǎng)彭德懷名義發(fā)表的3個(gè)文告，揭露了美國(guó)的侵略行徑和陰謀，劃清了中美兩國(guó)之間與國(guó)共兩黨之間的界限，在臺(tái)、澎、金、馬軍民中引起強(qiáng)烈的反響，加深了美蔣之間的矛盾。通過有條件暫停炮擊和無(wú)條件隔日炮擊的行動(dòng)，抵制了美國(guó)脅迫臺(tái)灣當(dāng)局從金、馬撤兵，隔離臺(tái)灣，制造“兩個(gè)中國(guó)”的圖謀。持續(xù)兩個(gè)多月的緊張局勢(shì)，也開始松弛下來。

　　金門炮戰(zhàn)中蔣介石反對(duì)把金門、馬祖與臺(tái)灣島割裂開來，堅(jiān)持“一個(gè)中國(guó)”的立場(chǎng)，在很大程度上與毛澤東達(dá)到了“共鳴”，并受到了毛澤東的贊許。1959年2月初，毛澤東在一次對(duì)省市委書記的講話中談到了國(guó)共兩黨秘密接觸的情況。他說：“臺(tái)灣是蔣介石當(dāng)‘總統(tǒng)’好？還是胡適好？還是陳誠(chéng)好？還是蔣介石好。但是國(guó)際活動(dòng)場(chǎng)合，有他我們就不去，至于當(dāng)‘總統(tǒng)’，還是他好。”“讓他(按：蔣介石)去搞特務(wù)，搞三民主義，歷史上凡是不應(yīng)當(dāng)否定的，都要作恰當(dāng)?shù)墓烙?jì)，不能否定一切，否定一切的結(jié)果，都?xì)Я俗约骸！?月27日，毛澤東在會(huì)見外賓時(shí)說：“現(xiàn)在我們又講跟蔣介石合作，他(按：蔣介石)說不干，我們說要。合作共同反美，他不敢，我們說有一天美國(guó)要整他，總會(huì)有一天美國(guó)要承認(rèn)我們的，丟掉他。蔣介石懂得這一點(diǎn)。我們搞第三次合作，他通過秘密的間接的方法跟我們聯(lián)系，公開不敢，怕美國(guó)，而我們不怕。”毛澤東還說，我們同臺(tái)灣，誰(shuí)也離不開誰(shuí)，就像《長(zhǎng)恨歌》中所說的：“在天愿作比翼鳥，在地愿為連理枝。”蔣介石把枝連著美國(guó)，而美國(guó)卻連根都要挖掉。9月15日，毛澤東在民主黨派負(fù)責(zé)人座談會(huì)上說：“蔣介石不做‘總統(tǒng)’，這個(gè)我們也不贊成的。……是蔣介石做‘總統(tǒng)’好，還是別人做‘總統(tǒng)’比較好？在目前看，還是蔣介石比較好。”

　　為了實(shí)現(xiàn)提出的“舉行和平談判”，毛澤東在炮擊金門的同時(shí)采取了另一個(gè)行動(dòng)，請(qǐng)與國(guó)共兩黨高層均有私交的章士釗擔(dān)負(fù)起兩岸溝通的責(zé)任。在金門炮戰(zhàn)硝煙未散盡時(shí)，毛澤東囑托章士釗給蔣介石寫信，把中共“聯(lián)蔣抵美”的方針告訴他。章士釗欣然答應(yīng)。國(guó)學(xué)功底極好的章士釗在信中說：“溪口花草無(wú)恙，奉化廬墓依然”；“臺(tái)灣金馬，唇齒相依，遙望南天，希諸珍重。”毛澤東對(duì)這幾句尤為欣賞，并親自將“南天”改為“南云”。

　　1958、1960年，章士釗兩次赴港，向臺(tái)灣當(dāng)局轉(zhuǎn)達(dá)信息。臨行之前，毛澤東、周恩來與他進(jìn)行了談話，提出了兩岸暫不舉行正式談判，但可先做有限接觸，如互訪、通郵、通航、通商的建議。章士釗到港后，引起了海外媒體的種種猜測(cè)，稱章士釗是中共的“和談專使”，擬通過私人關(guān)系向臺(tái)灣高層轉(zhuǎn)達(dá)中共和談條件。但是臺(tái)灣當(dāng)局對(duì)章士釗此行沒有作出任何積極反映。另外，受蔣介石派遣來大陸的宋宜山回到香港后，蔣介石并沒讓他回臺(tái)灣當(dāng)面匯報(bào)，而是讓他先寫一份書面報(bào)告。由于宋宜山的報(bào)告對(duì)共產(chǎn)黨和大陸的成就贊揚(yáng)過多，蔣介石看后大為不悅，認(rèn)為宋宜山被“赤化”了，而中止了國(guó)共間進(jìn)一步的接觸。