參加第十六屆海峽兩岸關系學術研討會的兩岸學者指出，陳水扁當局目前正極力推動“以臺灣名義加入聯合國的公投”，這是“臺獨”升級的重要步驟，將導致兩岸關系嚴重惡化。學者們也對國民黨推動“返聯公投”可能導致的嚴重后果表示擔憂。

　　全國臺聯顧問蘇民生分析，陳水扁當局以臺灣名義申請加入聯合國，是要讓世界各國把臺灣當成“主權獨立的國家”，這完全是癡心妄想，是絕對辦不到的。為什么明知辦不到的事情，陳水扁卻樂此不疲呢？因為他想借此挑起事端，以渾水摸魚，亂中獲利。

　　臺灣“海峽兩岸和平統一促進會”會長郭俊次在提交研討會的論文中說，“入聯公投”就是變相的“統獨公投”，只要正式啟動，其危險性不亞于“臺獨制憲”。為了臺灣，也為了大陸，大家應勇敢地站起來，公開批判、譴責、抵制和反對“入聯公投”。

　　臺灣勞動人權協會總干事王武郎說，“入聯公投”涉及改變臺海現狀，是變相的“統獨公投”，幾乎踩在《反分裂國家法》劃出的“紅線”上。如果陳水扁當局執意推動，將導致兩岸關系倒退惡化。

　　王武郎說，當前島內主要政治勢力任何制造“一中一臺”、“兩個中國”的主張和做法，都是無視聯合國第2758號決議和相關的國際法理和事實，最終都將遭到人民與歷史的否決。

　　第十六屆海峽兩岸關系學術研討會7月31日至8月1日在昆明舉行。研討會由全國臺灣研究會、中華全國臺灣同胞聯誼會、中國社會科學院臺灣研究所主辦。(陳斌華)